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公司新闻

精准医疗,全外显子组测序立功啦

发布时间:2015-04-09 11:06 |  点击次数:


精准医疗计划(Precision Medicine Initiative)是美国奥巴马总统在2015年国情咨文演讲中宣布的一项新的国家项目,并称将为建立大量志愿者服用药物的生理和基因资料、建立个人基因组与癌症相关突变靶标、数据标准开发与保密等工作投资共计2.15亿美元。

精准医疗无疑是医疗技术的未来发展方向,科研和医疗领域的专家们都在不断尝试将最新的技术运用到临床诊断过程中去。其实从2011年起,美国贝勒医学院的专家就开始了利用人类全外显子组测序进行遗传病机理挖掘的工作。比起人类全基因组,全外显子组测序检测的基因组区域虽然只有数十Mb,却可以获得充足的已知基因外显子区域的序列变化情况,在临床上的作用则显得更加明确且经济实用。配合大量正常人群突变数据、病例家系表型与基因型测序数据的解读,往往可以对许多遗传疾病发生机理进行很好的解读,甚至可以将遗传疾病的诊断率提高至25%1

近期的一篇关于罕见病研究的临床报道中,则愈发强调了全外显子组测序在遗传病临床诊断上的技术优势。梅奥诊所(Mayo Clinic)的神经学家们利用罗氏NimbleGenSeqCapVCRome全外显子组序列捕获及测序技术帮助了一位罕见病患者确认了其病因为发作性共济失调1型(Episodic ataxia type 1)2。NimbleGenSeqCapVCRome全外显子组捕获探针是梅奥诊断以及贝勒医学院在临床上广为使用的一项技术,这套探针组库覆盖了Vega,CCDS和RefSeq数据库中所有已知基因的全外显子组区域,能够在临床研究的过程中帮助锁定基因组位点突变,快速筛选有临床意义的侯选突变,结合以往病例信息与临床表型数据进行人工判读。随着新功能基因的不断解读以及数据库的更新,这种锁定已知基因的全外显子区域的测序方法能够大大减少通过各类传统检测方法所需要的实验时间以及经济成本,无疑于精准医疗发展道路上的一个快速有效的工具。

梅奥诊所的专家们也在这篇报道中指出:目前在商业化实验室中提供用于共济失调诊断的试剂盒花费是全外显子组测序的2倍,而且不包括一些特殊检测。此外,在临床非典型性共济失调案例中,尤其当临床和家族谱系数据缺乏的时候,首先考虑全外显子组测序是最为有效的。全外显子组测序在临床诊断中的应用可以加速遗传疾病的诊断,简化其数据管理,尤其适用于那些异质性、非典型的和表现不完全的遗传疾病诊断,还能帮助临床专家们为那些患稀有或新型遗传疾病的患者找到其致病根源。2

随着越来越多的临床报道都表现出全外显子组测序的优势,让我们共同期待这项技术的发展能够为精准医疗发挥更大的价值吧。

参考文献:

  1. Molecular Findings Among Patients Referred for Clinical Whole-Exome Sequencing.Yaping Yang et al. JAMA. 2014 Oct 18. DOI:10.1001
  2. Whole-Exome Sequencing as a Diagnostic Tool in a Family With Episodic Ataxia Type 1. Tacik, Pawel et al. Mayo Clinic Proceedings